A investigação no Instituto Bento da Rocha Cabral centra-se nas áreas das Ciências Biomédicas e História da Ciência.
Relativamente às Ciências Biomédicas, o grupo de investigação adotou uma perspetiva de estudo ao nível da Ecogenética e da Saúde humana e encontra-se estruturado de acordo com cinco linhas de investigação: Genética comportamental e ambiente, Ambiente e genética das doenças cardiovasculares e cancro, Ambiente e genética das doenças endócrinas e metabólicas, Doenças do metabolismo do ferro, e Síndrome metabólica: Obesidade e meio ambiente.
O foco principal da Investigação é entender como os fatores ambientais interagem com o património genético do indivíduo e vice-versa, modulando o risco para a saúde.